Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Grik3B1AS29 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Grik3B1AS29 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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