Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprsB0V2N1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms