Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tomm40Q9QYA2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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