Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp1Q9QY53 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nphp1Q9QY53 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms