Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rabgef1Q9JM13 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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