Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tnfrsf19Q9JLL3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tnfrsf19Q9JLL3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tnfrsf19Q9JLL3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tnfrsf19Q9JLL3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tnfrsf19Q9JLL3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms