Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms