Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra4Q9JJT2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms