Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR5

Lime1, Lck-interacting transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lime1Q9EQR5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Lime1Q9EQR5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms