Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms