Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn23Q9D7D7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms