Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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MsraQ9D6Y7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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