Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms