Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkrip1Q9CWV6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms