Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdm1Q9CQK3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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