Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl17Q9CPR4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl17Q9CPR4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms