Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim3Q99PE5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms