Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nup155Q99P88 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms