Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ms4a4dQ99N05 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms