Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp16Q99LG0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp16Q99LG0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp16Q99LG0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp16Q99LG0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp16Q99LG0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms