Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Ssh3Q8K330 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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