Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Cldn34c1Q8K193 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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