Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc38a2Q8CFE6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc38a2Q8CFE6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc38a2Q8CFE6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc38a2Q8CFE6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Slc38a2Q8CFE6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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