Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc21aQ8C0S4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttc21aQ8C0S4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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