Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms