Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ell3Q80VR2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.5 ms