Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms