Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc2bQ7TPM1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc2bQ7TPM1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms