Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim12Q78RX3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim12Q78RX3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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