Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbtb40Q6PCS8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Zbtb40Q6PCS8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbtb40Q6PCS8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms