Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltcQ68FD5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms