Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Sbno1Q689Z5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sbno1Q689Z5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms