Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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AtmQ62388 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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AtmQ62388 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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AtmQ62388 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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AtmQ62388 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AtmQ62388 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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