Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Mkrn3Q60764 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms