Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrrc47Q505F5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrrc47Q505F5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms