Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm28047Q3US59 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28047Q3US59 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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