Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b2Q3UJB0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms