Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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