Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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