Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms