Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 604.3 ms