Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Prr27Q3SYJ2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms