Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ttc21bQ0HA38 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ttc21bQ0HA38 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ttc21bQ0HA38 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc21bQ0HA38 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc21bQ0HA38 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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