Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf541Q0GGX2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms