Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.4 ms