Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms