Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sh3bp2Q06649 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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