Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Top2aQ01320 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms