Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms