Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cited1P97769 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms